天麻与土壤微生物关系密切,在接种蜜环菌前,就与各种细菌相互作用;种植后,蜜环菌、萌发菌以及菌材的加入,使得土壤微生物群落结构发生变化
[23]。近年来,关于天麻土壤微生物的研究日益增多。从数量上看,天麻生长土壤中细菌数量远高于放线菌和真菌
[5,9,24],土壤细菌主要为枯草芽孢杆菌、左乳酸芽孢杆菌,土壤真菌主要为毛霉菌、根霉菌,放线菌为诺卡菌和青铜小单胞菌
[6,24]。此外,较多学者将高通量测序技术应用于天麻生长土壤的微生物研究
[25-26],特别是在天麻连作障碍方面。土壤微生物群落结构的失衡是连作障碍发生的主要因素
[27]。蔡丽琼等
[28-29]研究显示,变形菌门、绿弯菌门、酸杆菌门为连作天麻根际土壤细菌群落中的优势菌门,变形菌门和酸杆菌门物种丰度随连作次数增加呈上升趋势,而绿弯菌门物种丰度则相反;担子菌门为重茬天麻根际土壤真菌群落的优势菌门,子囊菌门为新茬天麻根际土壤真菌群落的优势菌门。天麻连作种植会导致天麻根际土壤细菌和真菌群落丰度和多样性发生变化,如细菌数量减少,优势细菌丰度降低,病原菌增加等,打破了土壤的微生态区系平衡,进而弱化天麻长势,集聚天麻病虫害隐患,从而降低其产量和效益。